北京总队医院胃肠诊疗中心是部队建制单位。是一所集医疗、预防、保健、教学、科研为一体的医疗机构。是具有五十年深厚医学底蕴的全军规范试点医院，担负着党和军队的医疗、保健重任，同时面向社会接收来自全国各地及境外患者。以中西医结合平衡全面治疗各种久治不愈的胃炎、胃溃疡、胃结石、胃下垂、胃出血、十二指肠溃疡、结肠炎、直肠炎、胃痛、嗳气、胃胀、胃寒、胃酸、消化不良、胃痉挛、食道炎、胃扩张、萎缩性胃炎、糜烂性胃炎、浅表性胃炎、便秘、慢性腹泻等各种胃肠疾病，被誉为华北地区规模最大、设施最全，科研与技术力量雄厚的胃肠康复治疗中心。
97年被评为“三级乙等医院”，98年被授予北京市“首都绿化美化花园式单位”，99年被评为“爱婴医院”;医院有120项科研成果获部级科技进步奖，著书30余部，论文1500余篇，为武警部队科研先进单位。